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种子的SSR检测——高通量前处理解决方案

2016/11/29 17:17:32

    美国SPEX SamplePrep公司拥有60余年的专业样品前处理仪器生产经验和专业背景。SPEX GENO高通量组织研磨仪,开始是专门为杜邦旗下先锋良种农业(PIONEER)植物样品而研发。

SSR(又称微卫星DNA)标记,由于其共显性遗传特点,可以鉴定杂合子和纯合子。该标记法需要DNA量少,实验重复性好,可靠性高,操作简便、经济,因而已经成为种子鉴定中最常用的分子鉴定方法,并已经出现在一些种子真实性和纯度检测的标准中。

为了真正实现极高通量检测,在96孔深孔板的单孔中如能对单粒种子成功粉碎将是非常理想的。我们知道要将种子磨碎并不难,但要在如此狭小的空间内将坚硬的种子磨碎就不那么容易实现了。SPEX高通量组织研磨仪能轻松达到这一目的。培安公司应用工程师已整理出上百种样品的最佳前处理方案,下图为部分种子的研磨效果(每个图都是96孔深孔板单孔研磨单粒种子的结果):


 

值得注意的是,大麦、绿豆、黄豆这些带皮的种子,无须剥皮,研磨完成外皮自然脱落;像黄豆这样坚硬的种子,在单孔也成功粉碎;像葵花籽这样油性的种子,研磨结果虽有些结块,但是也呈泥浆状,拥有很好的细度。唯独玉米种子单粒较大,无法放入深孔板单孔中,但当我们将玉米种子放入15ml管中,也获得了下图的研磨效果:


玉米

我们知道,在进行种子真实性和纯度检测时,每个品种需要做一定数量的重复,尤其纯度检测时,至少需要100粒种子。在SSR分子标定步骤的第一步就需要破碎种子并提取DNA,这是一个非常繁重的手工劳动。如果SPEX Geno 加入工作,就可以一个人在几分钟之内就获得所有待测种子的模板DNA!而这往往是需要一个人几个工作日的劳动量!

Geno 2010一次可处理696孔深孔板,也就是说一次即可完成576个种子的DNA提取;一次可处理2415ml管,像玉米这样的大颗粒种子,一次也可以做24个不同样品的DNA提取。

种子检测领域和遗传育种领域的样品通量极高是众所周知的,也是让科研工作者颇为伤脑筋的问题。培安技术中心的应用工程师可根据您的样品为您提供方案,使得所有繁琐的前处理问题迎刃而解。

愿培安公司专业的前处理仪器和技术服务能早日为您的科研事业添砖加瓦。


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